房玄龄沉默一会，说道：“臣能为王爷效力亦是幸甚。”
“嗯，玄龄奔波一夜，定是累了，快去用些吃食，先休息吧。”
“臣告退。”
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房玄龄吃过饭，躺在床上，大概思考了一会计划便睡了过去。
直到晚上，被下人叫醒，房玄龄穿戴整齐，跟随下人来到议事厅，就见秦王一系已然到齐，秦王端坐主位。
“刚才圣人召我入宫，傅奕秘密上奏道：“金星出现在秦地的分野上，这是秦王应当拥有天下的征兆。”圣人将傅奕的密奏予我看了。某便趁机上奏父皇，告发李建成和李元吉与后宫的嫔妃淫乱，父皇已答应明日审理此事。诸位以为如何？”
“太子齐王已然动手，若我等再不反抗，难道等死不成？”
“齐王凶恶乖张，另外听说齐王已欲除去王爷后，在除去太子，若是如此，大唐交于齐王管理，此人毫无大志，与太子谋划尚未成功，便想着要取太子而代之，实非明主，若此人得了江山，则国将不国。”
“以王爷只能擒杀二人如反掌观纹一般容易，不可因小失大，应以江山社稷为重。”
“玄龄、克明，你二人如何看？”
杜如晦看向房玄龄，想要吃了他的心思都有了，之前一副自信满满的样子，自已来了长安才发现根本什么都没准备。此刻更不知该如何是好。
房玄龄只得开口：“现在仇怨已结，一旦祸患暗发，岂只是秦王府不可收拾，社稷存亡都成问题。秦王何不效仿周公平定管叔、蔡叔，以便安定皇室与国家。存亡的枢机，形势的危急，亦在此刻！”
却在此时，长孙氏却走了进来，众人不知如何，便闭口不言。长孙氏走到李世民面前跪坐，凑到耳边说了几句，就听李世民说到：“将他请进来。”
长孙氏出去没一会，便有一人进来：“小的东宫率更丞王眰见过秦王。”
“快快请起，夜间来访，可有要事？”
“今夜太子与齐王议事，太子对齐王说：‘现在，你已经得到秦王骁勇的将领和精锐的士兵，拥有兵马数万之多了。我与秦王在昆明池为你饯行，让勇士在帐幕里将秦王杀死，上奏父皇时就说他暴病身亡，父皇应该不会不相信。我自当让人进言，逼父皇将国家大事交给我处理。尉迟恭等人已经落到了你的手中，应该将他们悉数坑杀，谁敢不服！’”
众人听了这话，便交头接耳，整个议事厅嗡嗡作响。
尉迟恭更是站了起来：“如今王爷处事犹豫不定，这是何等愚昧；面临危难，不能决断。况且，大王平时畜养的八百多名勇士，他们穿好盔甲，手握兵器，起事的形势已经形成，大王怎么能够制止得住呢！”
“东宫紧邻玄武门，明日太子齐王入宫必然自此入宫，臣已买通玄武门守将常何、吕世衡、敬君弘三人，可将八百将士调入玄武门内，等太子等人进来便可擒之。”
房玄龄说完也不管杜如晦的眼光，接着说道：“王爷功盖天地，应当继承皇帝的大业。现在危机已至，正是上天在帮助王爷啊。希望王爷不要疑惑不定了。”
“克明，你怎么看？”
杜如晦此刻虽然明白是被房玄龄诓骗到这里的，却也无可奈何，当即站起身来：“箭在弦上，不得不发。即刻谋划一番，莫要耽搁了。”
此事基调便是定下，众人谋划近两个时辰，终是敲定，房玄龄杜如晦本不应出现在长安，由他二人带领部曲一百人，驻守秦王府。其余人随秦王入宫，王眰返回东宫以防生变。
武德九年六月初四，秦王李世民率领长孙无忌、尉迟敬德、宇文士及、高士廉、侯君集、程知节、秦叔宝、段志玄、屈突通、张士贵等人入朝，并在玄武门埋下伏兵。 张婕妤探知了李世民的谋划，暗中告知李建成。李建成于是与李元吉私下谋划策略，李元吉建议李建成称病不朝，李建成则认为京城防备严密，没有在乎。此时，李渊已经将裴寂、萧瑀、陈叔达、封德彝、裴矩等人召集前来，准备查验李建成、李元吉淫乱后宫这件事情。
李建成、李元吉来到临湖殿，察觉到了变化，立即调转马头，准备向东返回东宫和齐王府。李世民跟在后面呼唤他们，李元吉心虚，先张弓搭箭射向李世民，但由于心急，一连两三次都没有将弓拉满，箭没有射中。李世民搭弓射箭，射杀了李建成。而尉迟恭带领着七十余名骑兵相继赶到，他身边的将士用箭射中了李元吉，李元吉跌下马来。可就在此时，李世民的坐骑受到了惊吓，带着李世民奔入玄武门旁边的树林，李世民又被林中的树枝挂住，从马上摔下，倒地不起。李元吉迅速赶到，夺过弓来，准备勒死李世民，就在这时尉迟恭跃马奔来射杀李元吉。
太子李建成的部下、东宫翊卫车骑将军冯立得知李建成被困，与副护军薛万彻、屈直府左车骑谢叔方率领东宫和齐王府的精锐兵马两千人，急驰赶到玄武门。危急时刻，张公谨臂力过人，他独自关闭了大门，挡住冯立等人。东宫余党冯立、谢叔方率兵犯玄武门。而守卫玄武门的将领，云麾将军敬君弘挺身出战，与中郎将吕世衡向敌阵冲去，被东宫将领冯立所杀害，全部战死。
把守玄武门的士兵与东宫薛万彻等人奋力交战，薛万彻擂鼓呐喊，准备进攻秦王府。这时，尉迟恭提着李建成和李元吉的首级给薛万彻等人看，东宫和齐王府的人马顿失战心，迅速溃散，薛万彻与骑兵数十人则逃入终南山中。冯立则丢掉兵器，落荒而逃。
政变发生时李渊正在宫内的海池上划船，李世民让尉迟恭入宫担任警卫。尉迟恭身披铠甲，手握长予，径直来到李渊所在的船上。李渊大惊，问道：“今日作乱的人是谁?爱卿到此做什么?”尉迟恭回答道：“秦王因为太子和齐王作乱，起兵诛杀了他们。秦王殿下担心惊动陛下，故派臣担任警卫。”李渊对裴寂等人说：“不料今天竟然会出现这种事情，你们认为应当怎么办呢?”萧瑀和陈叔达说：“建成与元吉本来就没有参与举义兵反抗隋朝的谋略，又没有为天下立下功劳。他们嫉妒秦王功劳大，威望高，便一起策划奸邪的阴谋。现在，秦王已经声讨并诛杀了他们，秦王功盖宇宙，天下归心，陛下如果能够决定立他为太子，将国家大事委托于他，就不会再生事端了。”李渊说：“那便如此。”
当时，宿卫军和秦王府的兵马与东宫和齐王府的亲信交战还没有停止，尉迟恭请求高祖颁布亲笔敕令，命令各军一律接受秦王的节制，李渊只得听从。天策府司马宇文士及从东上阁门出来宣布敕令，战争才停下来。李渊又让黄门侍郎裴寂前往东宫开导原李建成麾下的诸将士，将士听说太子已死早就散了。
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